北京市第六医院前身为美国基督教长老会于1885年创办的“妇婴专科医院”，1917年更名为“道济医院”，1952年被北京市人民政府接管，命名为“北京市第六医院”至今，已有130余年的历史。一批著名的专家、学者曾在我院任职，如：协和医院著名妇产科专家林巧稚曾在我院工作并任董事会成员；原中国医科院院长、协和医院大内科主任邓家栋曾任我院内科主任；我国泌尿外科奠基人、友谊医院泌尿外科主任于惠元曾任我院外科主任等。
经过130余年的锤炼，医院已经成为一所设备先进、专业齐全、技术力量雄厚、服务水平较高、综合实力较强，集临床、科研、教学、预防、公共卫生为一体的二级甲等综合性医院，承担着地区近60万人的医疗、预防、保健任务及外省市医疗单位的会诊、接诊任务。
在东城区“十二五”卫生发展规划中，医院被确定为东城区区域中心。近年来，在东城区委、区政府和东城区卫计委的关怀下，医院确定了“立足东城，带动基层，努力建设成具有三级综合医院技术水平、能够引领带动区域医疗持续发展的东城区区域医疗中心”的123发展战略。
医院设有两个院区，本部坐落在交道口北二条31、36号，二部坐落在东直门内大街184号。医院总占地面积为17535平方米，建筑面积为35568平方米，总资产2.35亿元，职工近千人，其中具有高级职称人员100余名，研究生以上人员80余人。
医院编制床位632张，目前开放560张。设有一级科目25个，二级科目56个。开设35个临床专业科室，15个医技科室、3个临床实验室和24个病区。21个护理单元开展了优质护理服务工作，开展率达到100%。医院年门诊量为58万人次，年住院病人近10000人次。心血管内科、骨科、神经内科、消化内科、呼吸内科、妇产科、急诊科、眼科、泌尿外科、放射科为医院的重点科室，医疗技术水平与国内先进水平保持同步。心血管内科、骨科正在积极申请市级重点专科；神经内科、消化内科、呼吸内科、中医科正在努力申请区级重点专科。中医科已被北京市中医管理局授予为“北京市综合医院示范中医科”称号。
医院拥有现代化医疗设备，如GE公司1.5T奥运核磁共振;西门子64排128层螺旋CT;飞利浦心脏血管造影机；飞利浦数字化医用X射线摄影系统；西门子全数字移动式C形臂X射线机；西门子数字活检乳腺X光机；德国耶格肺功能检测系统；美国伟康睡眠检测系统；全自动生化分析仪；彩色超声多普勒诊断仪；血液透析机；多功能监护仪；有创、无创呼吸机；电子胃肠镜、纤维支气管镜、鼻窦镜、腹腔镜、关节镜、阴道镜、宫腔镜、膀胱镜等微创手术所需设备；全套的CCU、ICU监护抢救设备；设备设施完善的手术室、体检中心等可以较好的满足临床和患者需要。